| начало :: поиск :: подписка :: издатели :: карта сайта | |
| Том 05/N 1/2003 | ГОСПИТАЛЬНЫЕ ИНФЕКЦИИ |
Классификация
Важным диагностическим
признаком бактерий является их способность
утилизировать углеводы в качестве
источника питания и энергии при
выращивании in vitro. Базовым субстратом
служит глюкоза, которую бактерии разлагают
в процессе брожения (расщепление углеводов
в анаэробных условиях) либо дыхания (окисление
органических субстратов до СО2
и Н2О). Бактерии,
неспособные осуществлять процессы
брожения, относятся к так называемым
неферментирующим бактериям (НФБ). Эта
группа объединяет грамотрицательные
микроорганизмы разных семейств и родов Отдельные
представители грамположительных
коринеподобных бактерий из группы так
называемых дифтероидов (Brevibacterium, Turicella) тоже
не расщепляют глюкозу, но их не относят к
НФБ. (табл. 1).
Морфология
НФБ имеют форму палочек средних
и мелких (переходящих в кокки) размеров,
величина клеток может варьировать в
зависимости от состава питательной среды и
фазы роста микробной популяции; не
окрашиваются по Граму, но некоторые
представители (Moraxella spp.) обладают
повышенной устойчивостью к обесцвечиванию
спиртом. Спор не образуют, у многих имеется
капсула. Часть бактерий обладает
подвижностью за счет полярно расположенных
или перитрихиальных жгутиков, у некоторых
неподвижных видов (Acinetobacter spp.)
описано так называемое подергивающее
движение, которое усиливается с повышением
рН среды до 9,0.
Культуральные свойства
Наименее прихотливы к факторам
роста Pseudomonas, Alcaligenes, Acinetobacter;
прочие НФБ нуждаются в сложных по составу
питательных средах, нередко с добавлением
гемина и сыворотки крови человека или
животных. На кровяном агаре образуют
гладкие или шероховатые колонии диаметром
от 0,2 до 3 мм, отличающиеся по консистенции,
пигментообразованию, наличию или
отсутствию зоны гемолиза вокруг колоний на
кровяном агаре. За редким исключением (некоторые
виды Pseudomonas) не
растут при 42°С, для многих представителей
оптимальной температурой роста является
30–33°С. Большинство НФБ относится к строгим
аэробам. Некоторые виды Pseudomonas
способны к анаэробному росту в присутствии
нитритов и нитратов, если они используются
в качестве конечных акцепторов электронов;
при этом процесс накопления химической
энергии начинается с фосфорилирования
глюкозы [31].
Биохимическая активность слабо
выражена, что создает трудности при
идентификации. Они не образуют индол,
ацетилметилкарбинол, не ферментируют
глюкозу и другие углеводы, но многие виды
способны к окислению сахаров и
многоатомных спиртов без образования газа.
Часть НФБ характеризуется полной
инертностью по отношению к глюкозе, другие
– окисляют глюкозу путем
последовательного ее превращения в
ацетилкоэнзим А, который включается в цикл
Кребса, обеспечивающий обмен веществ в
клетках аэробных микроорганизмов [31]. При
этом разные виды одного рода (Pseudomonas
spp., Alcaligenes spp., Acinetobacter spp.)
и даже штаммы одного вида (Burkholderia cepacia) могут
отличаться по сахаролитической активности.
Протеолитическая активность слабо
выражена, однако для некоторых видов
способность разжижать свернутую сыворотку
и желатин является важным дифференциальным
признаком. За редким исключением НФБ оксидазоположительные,
что свидетельствует о наличии у них в цепи
транспорта электронов цитохрома c;
оксидазонегативные микроорганизмы (Acinetobacter
spp., Chryseomonas spp., Flaviomonas spp., S.maltophilia
и некоторые штаммы B.cepacia) имеют лишь
цитохромы a и b.
Антигенная структура НФБ
изучена недостаточно и практически
отсутствуют достоверные сведения об
антигенных взаимоотношениях между
представителями разных подгрупп, поэтому
серологические методы их идентификации не
нашли применения в практике.
Клиническое значение
НФБ достаточно широко
распространены в природе. Основные места их
обитания – вода, почва; они могут
выделяться из пищевых продуктов, часто из
молока; многие виды паразитируют в
организме здоровых людей и животных: на
коже, слизистых оболочках верхних
дыхательных путей, нижних отделов
мочевыводящего тракта, некоторые
представители входят в состав индигенной
флоры толстой кишки. Частота их выделения
из клинического материала достигает 15% от
всех аэробных и факультативно-анаэробных
грамотрицательных бактерий, из них около 70%
приходится на долю P. aeruginosa, Acinetobacter
spp. и S. maltophilia
[32]. Большинство НФБ рассматриваются как
условно-патогенные микроорганизмы,
поскольку имеются многочисленные
наблюдения их участия в инфекционном
процессе. Описаны случаи эпидемических
вспышек внутригоспитальных инфекций.
Экзогенным источником инфекции часто
служит ингаляционное оборудование,
хирургический инструментарий, растворы для
ингаляционного введения, катетеры, пищевые
трубки. Инфекция чаще возникает у больных с
ослабленным иммунитетом: у детей, стариков,
лиц с тяжелыми соматическими заболеваниями,
онкологических больных и больных
хроническим алкоголизмом; однако нередко
инфекционный процесс развивается у молодых
здоровых людей. Отмечается рост удельного
веса менингитов и пневмоний, вызванных НФБ.
По отдельным наблюдениям НФБ составляют
почти 20% всех положительных гемокультур [33].
В патофизиологии инфекционного процесса
основная роль принадлежит эндотоксинам,
хотя механизм возникновения инфекции не до
конца изучен.
Таблица 1 В табл. 1 не включены грамотрицательные не ферментирующие глюкозу прихотливые аэробы родов Brucella, Francisella, Legionella и микроаэрофилы родов Campylobacter, Helicobacter.. Таксономическая классификация НФБ [1, в модификации]
|
Род (Семейство) |
Вид |
Комментарий |
|
Achromobacter (Alcaligenaceae) |
A. xylosoxidans xylosoxidansa A. xylosoxidans denitrificansa A. piechaudiia A. ruchlandiia |
Обитают в воде |
|
Acidovorax (Comamonadaceae) |
A. delafieldiib A. facilisb A. temperansb |
Среда обитания мало изучена |
|
Acinetobacter (Moraxellaceaea) |
A. baumanii A. calcoaceticus A. haemoliticus A. johnsonii A. junii A. lwoffii A radioresistans |
Коменсалы кожи, конъюнктивы, глотки,
уретры, вагины Вызывают нозокомиальные
инфекции (абсцессы, инфекции
мочевыводящих путей, инфекционный
эндокардит, менингит, раневая инфекция,
сепсис) |
|
Agrobacterium (Rhizobiaceae) |
A. radiobacter |
Патогены растений |
|
Alcaligenes (Alcaligenaceae) |
A. faecalis A. latus |
Колонизируют кожу, ухо,
урогенитальный тракт |
|
Balneatrix ("Oceanosprillaceae") |
B. alpica |
Среда обитания мало изучена |
|
Bergeyella (Flavobacteriaceae) |
B. zoohelcum |
Составная часть ороназальной флоры
собаки |
|
Bordetella (Alcaligenaceae) |
B. parapertusis B. pertusis B. bronchiseptica B. hinzii B. holmseii B. trematum |
Возбудители коклюша, паракоклюша Могут вызывать бактериемию, отит, раневую инфекцию |
|
Brevundimonas (Caulobacteriaceae) |
B. diminutab B. vesicularisb |
Редко вызывают оппортунистические инфекции [12] |
|
Burkholderia ("Burkholderiaceae") |
B. maleib |
Возбудитель сапа B. gladioli – фитопатоген Могут вызывать бактериемию, инфекции нижних дыхательных путей, септический артрит [13] |
|
Chryseobacterium (Flavobacteriaceae) |
C. gleumc |
Обитают в больничной среде, воде |
|
Chryseomonas (Pseudomonadaceae) |
C. luteolab |
Коменсалы человека, не найдены в
окружающей среде |
|
Comamonas (Comamanadaceae) |
C. avenae |
Обитают в окружающей среде |
|
Delftia (Comamanadaceae) Flavimonas (Pseudomonadaceae) |
D. acidovoransd |
Описаны бактериемия, инфекционный
эндокардит [17] |
|
Flavobacterium (Flavobacteriaceae) |
CDC group IIe, IIh, IIi |
Обитают в окружающей среде, воде,
пищевых продуктах |
|
Methylobacterium ("Methylobacteriaceae") |
M. extorquens |
Обитают в окружающей среде |
|
Moraxella (Moraxellaceaea) |
M. atlantae |
Колонизируют кожу, слизистые
оболочки человека |
|
Myroides ("Myroidaceae") |
M. odoratusc |
Редко вызывает инфекцию мочевыводящих путей, раневую инфекцию при иммунодефицитах Характерна полирезистентность (бета-лактамы, аминогликозиды) [20] |
|
Ochrobactrum (Brucellaceae) |
O. antropie |
Обитают в окружающей среде, воде |
|
Oligella (Pseudomonadaceae) |
O. ureolitica |
Составная часть эндогенной флоры
мочевых путей (O. urethralis) |
|
Pseudomonas (Pseudomonadaceae) |
P. aeruginosa |
Обитают в воде, почве, растениях |
|
Psychrobacter (Moraxellaceae) |
P. immobilis |
Могут вызывать бактериемию, глазные инфекции, менингит [23] |
|
Ralstonia ("Ralstoniaceae") |
R. gilardiia |
Обитают в окружающей среде |
|
Roseomonas ("Methylobacteriaceae") |
R. cervicalis |
Среда обитания мало изучена |
|
Shewanella ("Alteromonadaceae") |
S. algae |
Обитают в окружающей среде, пищевых
продуктах |
|
Sphingobacterium (Sphingobacteriaceae) |
S. mizutaec |
Среда обитания мало изучена |
|
Sphingomonas ("Sphingomonadaceae") |
S. parapaucimobilis |
Обитают в окружающей среде, воде |
|
Stenotrophomonas ("Xantomonadaceae") |
S. maltophiliab |
Колонизирующая флора у пациентов,
получавших антибиотики широкого
спектра (чаще карбапенемы) |
|
Weeksella (Flavobacteriaceae) |
W. virosa |
Обитает в генитальном тракте женщин |
|
Xanthomonas ("Xantomonadaceae") |
X. campestris |
Среда обитания мало изучена |
|
Примечание. a – Ранее относились к Alcaligenes spp.; b – ранее относились к Pseudomonas spp.; c – ранее относились к Flavobacterium spp.;d – ранее относились к Comamonas spp.; e – ранее относились к Achromobacter spp.; f – ранее относились к Moraxella spp. |
||
Таблица 2. Типы реакций на полиуглеводном агаре Клиглера
|
Эталонный штамм |
Скошенная часть/Столбик |
Газ |
Н 2S |
|
|
реакция |
цвет |
|
|
|
|
E. coli ATCC 25922 |
кислота/кислота |
Желтый/желтый 1 |
+4 |
- |
|
S. typhimurium ATCC 14028 |
щелочь/кислота |
Красный/желтый 2 |
+ |
+5 |
|
Shigella flexneri ATCC 12022 |
щелочь/кислота |
Красный/желтый |
- |
- |
|
P. aeruginosa ATCC 21853 |
щелочь/щелочь |
Красный/красный 3 |
- |
- |
|
Примечание. 1 – ферментация глюкозы, сахарозы и/или лактозы; 2 – ферментация только глюкозы; 3 – отсутствие ферментации; 4 – разрывы и трещины в столбике агара; 5 – черное окрашивание среды. |
||||
Таблица 3. Трактовка результатов на ОФ-среде
|
Эталонный штамм |
Реакция (цвет) |
Характер метаболизма |
|
|
|
в пробирке без масла |
в пробирке под маслом |
|
|
P. aeruginosa ATCC 27853 |
Кислота (желтый) |
Щелочь (зеленый) |
Окисление |
|
K. pneumoniae ATCC 13883 |
Кислота (желтый) |
Кислота (желтый) |
Ферментация |
|
Moraxella osloensis ATCC 10973 |
Щелочь (зеленый) |
Щелочь (зеленый) |
Сахаролитическая инертность |
Уровень резистентности к антибиотикам
P. aeruginosa в ОРИТ (сводные данные по 9 городам России 1995–1996 гг. [2]).
Таблица 4. Дифференциация
Pseudomonas spp. и сходных бактерий [11, 19, 21]|
Микроорганизмы |
Окси даза |
Подвижность |
Мак- Конки |
Пиове- рдин |
Глю- коза |
Лак- тоза |
Маль- тоза |
Маннитол |
Арги нин - |
Лизин |
Нитрат нитрит |
Моче вина |
Эску лин |
Жела тин |
Поли миксин |
|
рРНК группа I |
|||||||||||||||
|
P. aeruginosa |
+ |
+ |
+ |
+ |
+ |
- |
- |
+/- |
+ |
- |
+/- |
+/- |
- |
+/- |
S |
|
P. fluorescens |
+ |
+ |
+ |
+/- |
+ |
-/+ |
-/+ |
+ |
+ |
- |
-/+ |
-/+ |
- |
+ |
S |
|
P. putida |
+ |
+ |
+ |
+/- |
+ |
-/+ |
-/+ |
-/+ |
+ |
- |
- |
-/+ |
- |
- |
S |
|
P. sturzeri |
+ |
+ |
+ |
- |
+ |
- |
+ |
+/- |
- |
- |
+/- |
-/+ |
- |
- |
S |
|
P. mendocina |
+ |
+ |
+ |
- |
+ |
- |
- |
- |
+ |
- |
+ |
+/- |
- |
- |
S |
|
P. alcaligenes |
+ |
+ |
+ |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
+/- |
-/+ |
- |
- |
S |
|
P. pseudoalcaligenes |
+ |
+ |
+ |
- |
+/- |
- |
-/+ |
- |
-/+ |
- |
+ |
- |
- |
- |
S |
|
рРНК группа II |
|||||||||||||||
|
B. malei |
+/w/- |
- |
- |
- |
+ |
+ |
+ |
+/- |
+ |
- |
- |
-/+ |
- |
- |
R |
|
B. pseudomalei |
+/w |
+ |
+ |
- |
+ |
+ |
+ |
+ |
+ |
- |
+/- |
-/+ |
+/- |
+ |
R |
|
B. cepacia |
+/w/- |
+ |
+ |
- |
+ |
+ |
+ |
+ |
- |
+/- |
-/+ |
-/+ |
+/- |
+/- |
R |
|
B. gladioli |
- |
+ |
Н/д |
- |
+ |
- |
- |
+ |
- |
- |
-/+ |
+ |
- |
- |
R |
|
R. picketii |
+ |
+ |
+ |
- |
+ |
- |
- |
- |
- |
- |
+ |
+ |
- |
-/+ |
R |
|
рРНК группа III |
|||||||||||||||
|
D. acidovoran s |
+ |
+ |
+ |
- |
+/- |
- |
- |
+ |
- |
- |
+/- |
- |
- |
- |
S/R |
|
C. terrigen a |
+ |
+ |
Н/д |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
+ |
- |
Н/д |
Н/д |
S |
|
C. testosteroni |
+ |
+ |
+/- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
+/- |
- |
- |
- |
S/R |
|
A. delafieldii |
+ |
+ |
Н/д |
- |
+ |
- |
- |
+ |
+ |
- |
+ |
+ |
- |
+ |
Н/д |
|
рРНК группа IV |
|||||||||||||||
|
B. diminuta |
+ |
+ |
+ |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
+/- |
S/R |
|
B. vesicularis |
+ |
+ |
-/+ |
- |
-/w |
- |
+/w |
- |
- |
- |
- |
- |
+ |
-/+ |
S/R |
|
рРНК группа V |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
S. maltophilia |
- |
+ |
+ |
- |
+ |
+/- |
+ |
- |
- |
+ |
-/+ |
- |
+ |
+ |
S |
|
Неизвестная гомология РНК |
|||||||||||||||
|
C. luteola |
- |
+ |
Н/д |
- |
+ |
- |
- |
+ |
+ |
- |
+ |
Н/д |
+ |
Н/д |
Н/д |
|
F. oryzihabitans |
- |
+ |
Н/д |
- |
+ |
- |
- |
+ |
- |
- |
- |
Н/д |
- |
Н/д |
Н/д |
|
S. putrefaciens |
+ |
+ |
+ |
- |
+/- |
- |
- |
- |
- |
- |
+ |
-/+ |
- |
+ |
S |
|
S. paucimobilis |
+/- |
+/- |
-/+ |
- |
+ |
+ |
+ |
- |
- |
- |
- |
- |
+ |
- |
S/R |
|
Примечание. + – 90% и более штаммов
положительные; - – 90% и более штаммов
отрицательные; +/- – 50–89% штаммов
положительные; |
|||||||||||||||
Общие принципы идентификации
Идентификация
Pseudomonas spp. и сходных бактерий
|
|
| © Издательство Media Medica, 2000. Почта :: редакция, webmaster |